8月18日至8月20日，2021中國足協杯第三輪在梅州、大連和武漢三個賽區進行，18支中甲球隊展開廝殺。最終 浙江隊、南通支云、北京北體大、成都蓉城、淄博蹴鞠、昆山隊、武漢三鎮、陜西長安競技、四川九牛這9支球隊淘汰對手晉級足協杯正賽。

受疫情影響，本次足協杯以賽會制方式進行。此前，2021中國足協杯前兩輪預賽已于7月31日至8月4日在黔南、鹽城和瀘西三個中乙賽區進行爭奪，最終西安駿狼、丹東騰躍、陜西俑士超越、U20國家隊、四川民足、青島青春島這6支中乙球隊殺出重圍，晉級足協杯正賽。

本次是由18支中甲球隊進行，值得一提的是，最近遭遇謝暉風波的南通支云，在比賽中0比6輸給黑龍江冰城，但由于對手在使用U23球員方面，中途有一段時間并沒有U23球員在場上，因此，最終這場比賽判黑龍江違規，南通支云晉級。最終由9支中甲球隊進行到正賽。

本賽季足協杯正賽將展開5輪爭奪，首輪計劃于10月16日-19日進行，16支中超球隊分別對陣16支低級別球隊，正賽第2輪至第5輪即分別為1/8決賽、1/4決賽、半決賽和決賽，其中1/4決賽和半決賽將采用兩回合制淘汰賽，其它各輪均為單場淘汰。最終的決戰計劃于11月舉行，兩支闖入決賽的球隊將一場決冠軍。